Trung tâm Y tế quận Tân Bình là đơn vị sự nghiệp y tế công lập trực thuộc Sở Y tế; chịu sự chỉ đạo, quản lý trực tiếp về tổ chức, nhân lực, hoạt động, tài chính và cơ sở vật chất của Sở Y tế; chịu sự chỉ đạo, kiểm tra, hướng dẫn về chuyên môn, nghiệp vụ của các đơn vị y tế tuyến thành phố, Trung ương và chịu sự quản lý nhà nước của Ủy ban nhân dân quận Tân Bình theo quy định của pháp luật.